《商业秘密保护规定》（市场监管总局令第126号，2026年6月1日施行）第三条：县级以上地方市场监督管理部门负责本行政区域内商业秘密行政保护工作；技术秘密案件一般由设区的市级以上市场监督管理部门管辖，根据工作需要，经国家市场监督管理总局同意，也可以由具有相应执法能力的县级市场监督管理部门管辖。启动方式包括举报、监督检查发现、其他部门移送、上级交办等；《反不正当竞争法》第二十条：任何单位和个人有权向监督检查部门举报不正当竞争行为，监督检查部门接到举报后应当依法及时处理，并为举报人保密。
监管实践中，商业秘密行政查处的管辖呈现“技术秘密上收、经营秘密属地”的格局：技术秘密案件涉及复杂技术比对与鉴定，由市级以上部门承办更有能力保障；经营秘密（客户名单等）案件多由县级部门按违法行为发生地管辖。重大、跨区域案件可由上级提级管辖或指定管辖。举报是主要启动方式，权利人举报时应当提供其商业信息属于商业秘密的初步证据材料以及该商业秘密涉嫌被侵犯的具体线索，并对举报内容的真实性负责（《商业秘密保护规定》第十七条）。
技术秘密案件优先向设区的市级市场监管部门（如温州市市场监管局）提交举报；经营秘密案件向违法行为发生地的县级以上市场监管部门提交；对管辖不确定的，可先电话咨询拟举报部门的公平竞争执法机构，确认对口处室；举报材料按“商业秘密初步证据＋涉嫌侵权具体线索”双要件组织，避免只写情况说明
《商业秘密保护规定》第十九条：市场监督管理部门收到举报线索后，应当依法进行核查，并决定是否立案。经核查，符合下列条件的，应当立案：（一）有证据初步证明存在侵犯商业秘密的行为，并依法应当给予行政处罚；（二）属于本部门管辖；（三）在给予行政处罚的法定期限内。调查措施见《反不正当竞争法》第十六条：进入经营场所检查；询问当事人及利害关系人；查询复制协议、账簿、单据、文件、记录、业务函电；查封扣押相关财物；查询银行账户。认定规则见《商业秘密保护规定》第二十条：有证据证明涉嫌侵权人所使用的信息与权利人主张的商业秘密实质相同，且涉嫌侵权人有获取商业秘密的条件，市场监管部门可以认定其存在侵犯商业秘密的行为，但有证据证明系合法获得或者使用的除外。
监管实践对立案采用“初步证据”标准：举报材料能合理指向秘密点、接触可能和使用迹象即可立案，不以民事胜诉标准或刑事追诉标准为门槛。查处中广泛运用鉴定：对不为公众所知悉与实质相同两个专门事项，可委托具有法定资质的鉴定机构鉴定或由有专门知识的人出具专业意见（《商业秘密保护规定》第二十二条）。电子数据取证（服务器日志、邮件、即时通讯记录、云盘操作记录）在涉密人员离职案件中成为关键证据。
立案前主动配合核查，按“秘密点清单＋三要件证明＋接触证据＋使用迹象”四段式补充材料；涉及电子证据的，先行公证或可信时间戳固定，并保留原始载体；对查封扣押、查询银行账户等措施，注意保存执法文书；实质相同推定规则下，被举报方若主张合法来源（独立研发、反向工程、合法受让），须准备反证
《反不正当竞争法》（2025年修订）第二十六条：经营者以及其他自然人、法人和非法人组织违反本法第十条规定侵犯商业秘密的，由监督检查部门责令停止违法行为，没收违法所得，处十万元以上一百万元以下的罚款；情节严重的，处一百万元以上五百万元以下的罚款。《商业秘密保护规定》第二十五条：责令停止违法行为的时间一般应当持续至有关商业信息不再构成商业秘密为止；责令停止一般包括责令停止使用、返还或销毁载体、销毁侵权产品或者中间品、清除获取的商业秘密等。第二十六条列举“情节严重”情形：造成权利人直接损失数额较大；对权利人生产经营活动造成重大不利影响；危害国家利益、社会公共利益；二年内因侵犯商业秘密受到行政处罚后再次实施；其他情节严重情形。
从市场监管总局近年公布的典型案例看，处罚呈现三方面趋势：一是“责令停止＋没收违法所得＋罚款”组合适用成为常态，违法所得与罚款并行计算；二是罚款幅度与侵权危害性、持续时间、损害程度挂钩，个案裁量空间大，从数万元到数百万元不等；三是对自然人（员工、前员工）与单位分别处罚，自然人罚款通常低于单位，但同样适用反法第二十六条。行政处罚决定依法记入信用记录并公示（《反不正当竞争法》第三十三条），对企业的投标、融资、上市造成现实影响。
评估处罚风险时，先测算“违法所得＋罚款”合计敞口，再评估是否构成情节严重（损失数额较大、再犯、影响重大等）；主动消除或者减轻违法行为危害后果的，依法从轻或者减轻行政处罚（《反不正当竞争法》第三十二条）；收到处罚告知书后，在告知期内及时行使陈述、申辩与要求听证的权利；对处罚决定不服的，依法申请行政复议或者提起行政诉讼（第三十六条）
《市场监督管理行政处罚程序规定》（市场监管总局令第42号修订）：收到举报材料后应当予以核查，核查期限一般不超过十五个工作日，特殊情况经批准可延长十五个工作日，检测、检验、检疫、鉴定以及权利人辨认或者鉴别等所需时间不计入；立案后适用普通程序办理的案件应当自立案之日起九十日内作出处理决定，因案情复杂或者其他原因不能在规定期限内作出处理决定的，经市场监督管理部门负责人批准，可以延长三十日，案情特别复杂或者有其他特殊情况的，由负责人集体讨论决定是否继续延期并确定延长的合理期限。处罚程序含告知（处罚告知书）、听证（吊销许可证、较大数额罚款等情形）、决定与送达。
实践提示：核查期限与办案期限是约束执法机关的程序时限，超期未决的，当事人可通过信访、上级机关督办或行政复议督促；涉及技术鉴定的案件，鉴定期间不计入办案期限，实际周期往往长于纸面时限；听证是商业秘密案件中当事人重要的程序抗辩机会，尤其是对“不为公众所知悉”“实质相同”的鉴定意见有异议时。
跟进各节点并记录文号与日期：受理回执、立案决定、调查笔录、处罚告知、听证通知、处罚决定；收到处罚告知书后，如需听证，在法定期限内书面申请；对鉴定意见有异议的，申请重新鉴定或补充鉴定；同步准备行政复议或行政诉讼的救济材料，把握六十日复议与六个月诉讼期限
《商业秘密保护规定》第二十七条：违反本规定，涉嫌犯罪的，依法移送司法机关追究刑事责任。国务院《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》：行政执法机关在依法查处违法行为过程中，发现违法事实涉及的金额、违法事实的情节、违法事实造成的后果等，涉嫌构成犯罪，依法需要追究刑事责任的，必须依照规定向公安机关移送，不得以行政处罚代替刑事追究。侵犯商业秘密罪的入罪门槛（“情节严重”）依2025年两高《关于办理侵犯知识产权刑事案件适用法律若干问题的解释》第十七条：给商业秘密的权利人造成损失数额或者因侵犯商业秘密违法所得数额在三十万元以上的；二年内因实施侵犯商业秘密行为受过刑事处罚或者行政处罚后再次实施，造成损失数额或者违法所得数额在十万元以上的。
实践中的行刑衔接路径：市场监管部门在查处中发现涉案金额达到追诉标准、涉嫌犯罪的，依法移送公安机关；公安机关立案后，行政案件与刑事案件并行处理，行政处罚决定可作为刑事案件的证据材料，反之刑事立案后行政程序通常中止或终结。移送的触发关键是对损失或违法所得数额的认定：行政处罚程序中已查明的违法所得，可直接作为判断是否达到刑事追诉标准的依据。权利人发现侵权损失达到追诉标准的，可书面请求市场监管部门移送公安并跟踪移送进度。
行政查处期间同步测算损失数额与违法所得，判断是否触及三十万元（或再犯十万元）追诉线；达到追诉标准的，书面请求执法机关移送公安并保留申请记录；行政处罚决定书、调查笔录、鉴定意见是后续刑事、民事程序的有利证据，妥善保存；注意行政程序中披露的证据材料，防止因举证造成二次泄露